Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E1P36543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP6V1E1P36543 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms