Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSP1P33241 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSP1P33241 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSP1P33241 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSP1P33241 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSP1P33241 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSP1P33241 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSP1P33241 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSP1P33241 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSP1P33241 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSP1P33241 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSP1P33241 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSP1P33241 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSP1P33241 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSP1P33241 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSP1P33241 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSP1P33241 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSP1P33241 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSP1P33241 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSP1P33241 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSP1P33241 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSP1P33241 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSP1P33241 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LSP1P33241 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSP1P33241 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSP1P33241 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSP1P33241 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSP1P33241 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSP1P33241 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSP1P33241 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSP1P33241 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSP1P33241 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSP1P33241 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSP1P33241 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSP1P33241 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSP1P33241 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms