Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD40LGP29965 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD40LGP29965 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms