Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINB3P29508 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB3P29508 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms