Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFS1P28331 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS1P28331 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFS1P28331 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms