Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX7P23759 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX7P23759 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX7P23759 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX7P23759 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX7P23759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX7P23759 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX7P23759 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX7P23759 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX7P23759 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX7P23759 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX7P23759 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAX7P23759 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAX7P23759 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX7P23759 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX7P23759 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX7P23759 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX7P23759 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX7P23759 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX7P23759 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX7P23759 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX7P23759 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX7P23759 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX7P23759 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX7P23759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX7P23759 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX7P23759 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX7P23759 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX7P23759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX7P23759 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX7P23759 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAX7P23759 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAX7P23759 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX7P23759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX7P23759 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX7P23759 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX7P23759 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX7P23759 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX7P23759 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX7P23759 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX7P23759 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX7P23759 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX7P23759 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms