Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGCP20142 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGCP20142 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGCP20142 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGCP20142 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGCP20142 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGCP20142 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGCP20142 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGCP20142 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGCP20142 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGCP20142 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGCP20142 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGCP20142 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGCP20142 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGCP20142 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGCP20142 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGCP20142 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGCP20142 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGCP20142 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGCP20142 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGCP20142 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGCP20142 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGCP20142 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGCP20142 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGCP20142 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGCP20142 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGCP20142 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGCP20142 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGCP20142 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGCP20142 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGCP20142 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGCP20142 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGCP20142 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGCP20142 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGCP20142 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGCP20142 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGCP20142 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGCP20142 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGCP20142 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGCP20142 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGCP20142 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGCP20142 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms