Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2F2P13984 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2F2P13984 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2F2P13984 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2F2P13984 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2F2P13984 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2F2P13984 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2F2P13984 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2F2P13984 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2F2P13984 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2F2P13984 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2F2P13984 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2F2P13984 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms