Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAR2AP13861 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKAR2AP13861 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAR2AP13861 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRKAR2AP13861 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAR2AP13861 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms