Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM228BP0C875 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms