Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00032P0C843 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00032P0C843 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00032P0C843 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00032P0C843 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00032P0C843 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms