Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPBP07199 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPBP07199 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPBP07199 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPBP07199 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPBP07199 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPBP07199 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPBP07199 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CENPBP07199 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPBP07199 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CENPBP07199 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CENPBP07199 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPBP07199 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPBP07199 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPBP07199 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPBP07199 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPBP07199 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPBP07199 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPBP07199 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPBP07199 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPBP07199 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPBP07199 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CENPBP07199 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CENPBP07199 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CENPBP07199 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPBP07199 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CENPBP07199 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CENPBP07199 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPBP07199 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPBP07199 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPBP07199 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPBP07199 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CENPBP07199 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CENPBP07199 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CENPBP07199 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CENPBP07199 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CENPBP07199 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CENPBP07199 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CENPBP07199 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CENPBP07199 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CENPBP07199 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPBP07199 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPBP07199 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CENPBP07199 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPBP07199 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPBP07199 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPBP07199 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPBP07199 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CENPBP07199 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPBP07199 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPBP07199 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CENPBP07199 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPBP07199 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPBP07199 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPBP07199 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPBP07199 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPBP07199 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPBP07199 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPBP07199 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CENPBP07199 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CENPBP07199 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPBP07199 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPBP07199 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPBP07199 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPBP07199 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CENPBP07199 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CENPBP07199 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CENPBP07199 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CENPBP07199 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CENPBP07199 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPBP07199 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPBP07199 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPBP07199 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPBP07199 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CENPBP07199 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms