Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EGFRP00533 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EGFRP00533 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EGFRP00533 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
EGFRP00533 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
EGFRP00533 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
EGFRP00533 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EGFRP00533 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
EGFRP00533 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EGFRP00533 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EGFRP00533 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EGFRP00533 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EGFRP00533 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
EGFRP00533 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
EGFRP00533 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EGFRP00533 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EGFRP00533 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
EGFRP00533 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EGFRP00533 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
EGFRP00533 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EGFRP00533 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EGFRP00533 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EGFRP00533 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EGFRP00533 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EGFRP00533 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFRP00533 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EGFRP00533 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFRP00533 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EGFRP00533 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EGFRP00533 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EGFRP00533 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EGFRP00533 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EGFRP00533 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EGFRP00533 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EGFRP00533 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EGFRP00533 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EGFRP00533 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EGFRP00533 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EGFRP00533 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFRP00533 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFRP00533 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFRP00533 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EGFRP00533 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EGFRP00533 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EGFRP00533 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EGFRP00533 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EGFRP00533 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EGFRP00533 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EGFRP00533 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EGFRP00533 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EGFRP00533 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EGFRP00533 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EGFRP00533 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFRP00533 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EGFRP00533 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EGFRP00533 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EGFRP00533 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EGFRP00533 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EGFRP00533 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EGFRP00533 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EGFRP00533 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EGFRP00533 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms