Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A2O94788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A2O94788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms