Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH16O75452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH16O75452 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH16O75452 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH16O75452 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH16O75452 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH16O75452 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH16O75452 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH16O75452 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH16O75452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH16O75452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH16O75452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH16O75452 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH16O75452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH16O75452 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH16O75452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH16O75452 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH16O75452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH16O75452 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH16O75452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH16O75452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH16O75452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH16O75452 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH16O75452 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH16O75452 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH16O75452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH16O75452 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH16O75452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH16O75452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH16O75452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH16O75452 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH16O75452 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH16O75452 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH16O75452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH16O75452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH16O75452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH16O75452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH16O75452 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH16O75452 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RDH16O75452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RDH16O75452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RDH16O75452 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RDH16O75452 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH16O75452 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH16O75452 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH16O75452 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH16O75452 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH16O75452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH16O75452 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH16O75452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH16O75452 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH16O75452 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH16O75452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH16O75452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH16O75452 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH16O75452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH16O75452 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH16O75452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH16O75452 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms