Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTIPO60759 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTIPO60759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms