Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC26A4O43511 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A4O43511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A4O43511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A4O43511 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A4O43511 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A4O43511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC26A4O43511 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC26A4O43511 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC26A4O43511 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC26A4O43511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC26A4O43511 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC26A4O43511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A4O43511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A4O43511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A4O43511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A4O43511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A4O43511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC26A4O43511 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC26A4O43511 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms