Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC11O43248 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC11O43248 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms