Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SETD1AO15047 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SETD1AO15047 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1AO15047 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1AO15047 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETD1AO15047 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms