Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2CO00762 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UBE2CO00762 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms