Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BN98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BN98 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BN98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BN98 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BN98 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BN98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BN98 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BN98 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BN98 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BN98 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BN98 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BN98 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BN98 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BN98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BN98 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BN98 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BN98 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BN98 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BN98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BN98 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BN98 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H3BN98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BN98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BN98 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BN98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BN98 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BN98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BN98 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BN98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BN98 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BN98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BN98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BN98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BN98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BN98 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BN98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BN98 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BN98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BN98 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BN98 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BN98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BN98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BN98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BN98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BN98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BN98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BN98 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BN98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BN98 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BN98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms