Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPB15A6NHN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB15A6NHN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPIPB15A6NHN6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPB15A6NHN6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms