Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GMNCA6NCL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GMNCA6NCL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms