Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBASA2RRP1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBASA2RRP1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms