Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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TCRBV7S3A2A0A539 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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TCRBV7S3A2A0A539 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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TCRBV7S3A2A0A539 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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TCRBV7S3A2A0A539 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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TCRBV7S3A2A0A539 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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TCRBV7S3A2A0A539 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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TCRBV7S3A2A0A539 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV7S3A2A0A539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV7S3A2A0A539 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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