Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1B0GVL5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GVL5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GVL5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms