Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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