Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 311.01□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 39.66□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-214ENST00000520252 639 ntTSL 29.61□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-223ENST00000522534 796 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-239ENST00000561150 568 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-224ENST00000522537 608 ntTSL 37.43□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-209ENST00000519477 707 ntTSL 56.91□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-212ENST00000520046 679 ntTSL 36.33□□□□□ -1.43e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 35.84□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 NUP85-221ENST00000583548 562 ntTSL 55.8□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 NUP85-204ENST00000577208 572 ntTSL 42.44□□□□□ -2.021e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-208ENST00000574468 1021 ntTSL 26.61□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 55.09□□□□□ -1.598e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.728e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-201ENST00000397193 1277 ntTSL 24.23□□□□□ -1.738e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0B-202ENST00000461670 530 ntTSL 515.21■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0B-209ENST00000496131 962 ntTSL 312.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0B-207ENST00000472505 411 ntTSL 511.14□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 NAGK-223ENST00000524537 453 ntTSL 310.78□□□□□ -0.682e-12■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 FBF1-202ENST00000585990 4481 ntTSL 210.92□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 29.91□□□□□ -0.827e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.617e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 NR1H2-206ENST00000597085 874 ntTSL 313.81□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 TNPO2-212ENST00000588491 737 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA1-207ENST00000547870 920 ntTSL 35.19□□□□□ -1.582e-18■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA1-213ENST00000551702 481 ntTSL 30.8□□□□□ -2.282e-18■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-203ENST00000606225 1950 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-214ENST00000635324 799 ntTSL 56.39□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 54.16□□□□□ -1.744e-8■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 318.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 29.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 STT3B-202ENST00000423527 1664 ntTSL 221.03■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 XPC-204ENST00000455144 958 ntTSL 46.04□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 39.96□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 EIF3F-202ENST00000528653 739 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 PDHX-205ENST00000526309 574 ntTSL 39.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 NUP98-213ENST00000524563 841 ntTSL 35.86□□□□□ -1.475e-9■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-204ENST00000394327 1408 ntTSL 55.23□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 59.83□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-205ENST00000526009 747 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-13■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-209ENST00000527299 387 ntTSL 22.09□□□□□ -2.072e-13■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 TPCN1-222ENST00000552897 596 ntTSL 420.36■□□□□ 0.852e-11■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-207ENST00000452293 609 ntTSL 422.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-209ENST00000465672 550 ntTSL 413.93□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 413.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-204ENST00000430747 563 ntTSL 211.02□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 310.92□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 RETREG2-206ENST00000452022 729 ntTSL 38.09□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 TTC37-207ENST00000507805 1321 ntTSL 55.48□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 POLD1-207ENST00000596425 563 ntTSL 312.18□□□□□ -0.467e-9■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 CHD2-228ENST00000637613 986 ntTSL 51.93□□□□□ -2.13e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-17■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 SUPT16H-207ENST00000557394 2324 ntTSL 27.16□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-211ENST00000510194 570 ntTSL 414.45□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-207ENST00000505689 925 ntTSL 510.83□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-203ENST00000503229 543 ntTSL 59.91□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-202ENST00000500692 2319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-208ENST00000507107 556 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GNPDA1-205ENST00000504139 754 ntTSL 57.39□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MTCH2-203ENST00000530428 930 ntTSL 515.56■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 MTCH2-206ENST00000539759 581 ntTSL 54.23□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 AP1G1-211ENST00000565642 2794 ntTSL 55.02□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 31.7
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 489.8 ms