Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms