Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms