Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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