Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms