Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S100A1P23297 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms