Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP1P11387 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP1P11387 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP1P11387 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP1P11387 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms