Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms