Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CNIH3-208ENST00000483512 968 ntTSL 218.64■□□□□ 0.573e-6■■■□□ 15.7
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TARDBPQ13148 CNIH3-213ENST00000498126 778 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-6■■■□□ 15.7
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TARDBPQ13148 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.367e-8■■■□□ 15.5
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TARDBPQ13148 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.277e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.28e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.088e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 513.85□□□□□ -0.198e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.559e-12■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.93e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 57.7□□□□□ -1.183e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 57.56□□□□□ -1.21e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)20.18■□□□□ 0.825e-7■■■□□ 15.5
TARDBPQ13148 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.045e-7■■■□□ 15.5
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TARDBPQ13148 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-9■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-8■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 PAXIP1-206ENST00000473219 5515 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-8■■■□□ 15.4
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