RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483512.5

CNIH3-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNIH3, Length 968 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-208ENST00000483512 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.32■■■■■ 4.85
CNIH3-208ENST00000483512 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
CNIH3-208ENST00000483512 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.12■■■■■ 4.17
CNIH3-208ENST00000483512 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.11■■■■■ 4.17
CNIH3-208ENST00000483512 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.8■■■■□ 3.96
CNIH3-208ENST00000483512 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.89
CNIH3-208ENST00000483512 NACADO15069 1562 aa39.25■■■■□ 3.87
CNIH3-208ENST00000483512 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.77■■■■□ 3.8
CNIH3-208ENST00000483512 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.76■■■■□ 3.8
CNIH3-208ENST00000483512 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.73■■■■□ 3.79
CNIH3-208ENST00000483512 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.68■■■■□ 3.78
CNIH3-208ENST00000483512 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
CNIH3-208ENST00000483512 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.38■■■■□ 3.73
CNIH3-208ENST00000483512 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.26■■■■□ 3.71
CNIH3-208ENST00000483512 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.14■■■■□ 3.7
CNIH3-208ENST00000483512 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CNIH3-208ENST00000483512 SCRIBQ14160 1630 aa37.39■■■■□ 3.58
CNIH3-208ENST00000483512 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.38■■■■□ 3.57
CNIH3-208ENST00000483512 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
CNIH3-208ENST00000483512 CUX2O14529 1486 aa37.16■■■■□ 3.54
CNIH3-208ENST00000483512 ERCC6Q03468 1493 aa36.72■■■■□ 3.47
CNIH3-208ENST00000483512 NCAPD3P42695 1498 aa36.34■■■■□ 3.41
CNIH3-208ENST00000483512 TRIM41Q8WV44 630 aa36.33■■■■□ 3.41
CNIH3-208ENST00000483512 NESP48681 1621 aa36.12■■■■□ 3.37
CNIH3-208ENST00000483512 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.02■■■■□ 3.36
CNIH3-208ENST00000483512 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CNIH3-208ENST00000483512 HMGXB3Q12766 1538 aa35.88■■■■□ 3.33
CNIH3-208ENST00000483512 SMARCA2P51531 1590 aa35.78■■■■□ 3.32
CNIH3-208ENST00000483512 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.62■■■■□ 3.29
CNIH3-208ENST00000483512 SMARCA4P51532 1647 aa35.57■■■■□ 3.28
CNIH3-208ENST00000483512 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
CNIH3-208ENST00000483512 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.51■■■■□ 3.28
CNIH3-208ENST00000483512 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.47■■■■□ 3.27
CNIH3-208ENST00000483512 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.3■■■■□ 3.24
CNIH3-208ENST00000483512 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.28■■■■□ 3.24
CNIH3-208ENST00000483512 OSCARQ8IYS5 282 aa35.26■■■■□ 3.24
CNIH3-208ENST00000483512 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CNIH3-208ENST00000483512 WDR62O43379 1518 aa35.24■■■■□ 3.23
CNIH3-208ENST00000483512 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.16■■■■□ 3.22
CNIH3-208ENST00000483512 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.9■■■■□ 3.18
CNIH3-208ENST00000483512 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
CNIH3-208ENST00000483512 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
CNIH3-208ENST00000483512 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
CNIH3-208ENST00000483512 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.84■■■■□ 3.17
CNIH3-208ENST00000483512 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.71■■■■□ 3.15
CNIH3-208ENST00000483512 ARHGEF11O15085 1522 aa34.67■■■■□ 3.14
CNIH3-208ENST00000483512 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CNIH3-208ENST00000483512 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.5■■■■□ 3.11
CNIH3-208ENST00000483512 CFTRP13569 1480 aa34.49■■■■□ 3.11
CNIH3-208ENST00000483512 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CNIH3-208ENST00000483512 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
CNIH3-208ENST00000483512 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CNIH3-208ENST00000483512 WIZO95785 1651 aa34.32■■■■□ 3.08
CNIH3-208ENST00000483512 ARAP1Q96P48 1450 aa34.27■■■■□ 3.08
CNIH3-208ENST00000483512 IFT140Q96RY7 1462 aa34.24■■■■□ 3.07
CNIH3-208ENST00000483512 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CNIH3-208ENST00000483512 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CNIH3-208ENST00000483512 TOPBP1Q92547 1522 aa33.91■■■■□ 3.02
CNIH3-208ENST00000483512 CHD1O14646 1710 aa33.88■■■■□ 3.01
CNIH3-208ENST00000483512 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CNIH3-208ENST00000483512 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
CNIH3-208ENST00000483512 FBLN2P98095 1184 aa33.82■■■■□ 3
CNIH3-208ENST00000483512 PRDM2Q13029 1718 aa33.76■■■■□ 3
CNIH3-208ENST00000483512 ABCC8Q09428 1581 aa33.73■■■□□ 2.99
CNIH3-208ENST00000483512 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CNIH3-208ENST00000483512 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.64■■■□□ 2.98
CNIH3-208ENST00000483512 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.63■■■□□ 2.97
CNIH3-208ENST00000483512 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.53■■■□□ 2.96
CNIH3-208ENST00000483512 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CNIH3-208ENST00000483512 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
CNIH3-208ENST00000483512 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.44■■■□□ 2.94
CNIH3-208ENST00000483512 SYNJ1O43426 1573 aa33.42■■■□□ 2.94
CNIH3-208ENST00000483512 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
CNIH3-208ENST00000483512 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.39■■■□□ 2.94
CNIH3-208ENST00000483512 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.37■■■□□ 2.93
CNIH3-208ENST00000483512 SOGA1O94964 1423 aa33.31■■■□□ 2.92
CNIH3-208ENST00000483512 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
CNIH3-208ENST00000483512 WDR97A6NE52 1622 aa33.24■■■□□ 2.91
CNIH3-208ENST00000483512 SYNJ2O15056 1496 aa33.22■■■□□ 2.91
CNIH3-208ENST00000483512 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
CNIH3-208ENST00000483512 GRIN2BQ13224 1484 aa33.18■■■□□ 2.9
CNIH3-208ENST00000483512 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.08■■■□□ 2.89
CNIH3-208ENST00000483512 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33■■■□□ 2.87
CNIH3-208ENST00000483512 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.89■■■□□ 2.86
CNIH3-208ENST00000483512 CUX1P39880 1505 aa32.86■■■□□ 2.85
CNIH3-208ENST00000483512 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.84■■■□□ 2.85
CNIH3-208ENST00000483512 CEP170Q5SW79 1584 aa32.8■■■□□ 2.84
CNIH3-208ENST00000483512 PBRM1Q86U86 1689 aa32.78■■■□□ 2.84
CNIH3-208ENST00000483512 GRIN2AQ12879 1464 aa32.74■■■□□ 2.83
CNIH3-208ENST00000483512 NUP160Q12769 1436 aa32.74■■■□□ 2.83
CNIH3-208ENST00000483512 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.67■■■□□ 2.82
CNIH3-208ENST00000483512 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.67■■■□□ 2.82
CNIH3-208ENST00000483512 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.67■■■□□ 2.82
CNIH3-208ENST00000483512 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.67■■■□□ 2.82
CNIH3-208ENST00000483512 SHROOM2Q13796 1616 aa32.66■■■□□ 2.82
CNIH3-208ENST00000483512 ADAMTS12P58397 1594 aa32.52■■■□□ 2.8
CNIH3-208ENST00000483512 KDM6BO15054 1643 aa32.49■■■□□ 2.79
CNIH3-208ENST00000483512 MAPKBP1O60336 1514 aa32.49■■■□□ 2.79
CNIH3-208ENST00000483512 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
CNIH3-208ENST00000483512 DIP2BQ9P265 1576 aa32.48■■■□□ 2.79
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