Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms