Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms