Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms