Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNKO75909 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms