Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD5O60279 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms