Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms