Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CBFBQ13951 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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