Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms