Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms