Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OIP5O43482 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OIP5O43482 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms