Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PRKD1Q15139 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PRKD1Q15139 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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