Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GAPVD1Q14C86 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms