Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms